Eskişehirspor kuruluşu diğer kulüplerin kuruluşuna hiç benzemez. Eskişehirspor'u ne İstanbul takımları nede İzmir takımlarında olduğu gibi yabancı uyruklular tarafından kurulmamıştır.Ne de holdinglerin toplanmasıyla oluşmuştur. Eskişehirspor Eskişehir'in bağrından çıkmıştır.
1963 yılında Türkiye akademiler arası futbol şampiyonası düzenlenir. Eskişehir ticari ilimler akademisi finalde Ege Üniversitesini 6-0 gibi büyük bir farkla mağlup eder. Maçın bitiminin ardından gözlemci Burhanettin Türker, kafile başkanı Nafiz Yazıcıoğlu'nun kulağına şunları söyler " Madem elinizde böyle bir kadro var neden 2.lige katılmıyorsunuz " 1965 yılında Eskişehirspor kurulur ve başkanlığına Aziz Bolel getirilir. Akademispor'un birçok futbolcusu Eskişehirspor'un formasını giyer.Takımın renkleri siyah ve kırmızı olarak belirlenir. Es-Es aldığı başarılar nedeniyle daha sonraki on yıl boyunca Anadolu'da kurulan tüm takımlar Eskişehirspor'u örnek alır. Siyah kırmızı renkleriyle birlikte. Eskişehirspor'u örnek alan kulüpler bugün 1. ligde başarıdan başarıya koşar.
Eskişehirspor'un birde lakabı var.Ona Kırmızı Şimşekler derler. Es-Es'in renklerini almayanlar lakabını almıştır. Anadolu'daki birçok takımın lakabı şöyledir: Mor şimşek, Mavi şimşek, Kara şimşek bu örnekler sürüp gider.